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Équilibre de Hardy-Weinberg : fréquences alléliques, porteurs et test du khi-deux

Calculez les fréquences des allèles et des génotypes à partir de la fréquence d'un caractère récessif ou des effectifs observés, avec les porteurs et un test du khi-deux.

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Résultats

Fréquence de l'allèle dominant (p)

0,5950

Fréquence de l'allèle récessif (q)

0,4050

Porteurs Aa attendus (2pq)

48,20 %

AA attendus (p²)
35,40 %
aa attendus (q²)
16,403 %
Porteurs : une personne sur
2,1
Khi-deux (1 degré de liberté)
0,615
P-value du test d'équilibre
0,4330
Compatible avec l'équilibre

Test d'équilibre pour d'autres effectifs aa

Fréquence de l'allèle récessif (q)Khi-deux (1 degré de liberté)P-value du test d'équilibre
110 aa actuel0,36705,4460,0196
140 aa actuel0,38660,4540,5006
170 aa actuel0,40500,6150,4330
200 aa actuel0,42234,3270,0375
230 aa actuel0,438710,5290,0012
260 aa actuel0,454118,5050,0000

Ce que dit le principe de Hardy-Weinberg

En 1908, le mathématicien G. H. Hardy et le médecin Wilhelm Weinberg ont montré, chacun de leur côté, que dans une grande population où les unions se font au hasard, les fréquences des allèles et des génotypes restent constantes d’une génération à l’autre. Si un gène possède deux allèles de fréquences p et q, les génotypes apparaissent dans des proportions fixes : p², 2pq et q². Cette référence permet d’estimer le nombre de porteurs d’un allèle récessif et de repérer ce qui fait évoluer une population.

Les formules

  • p + q = 1
  • p² + 2pq + q² = 1 : génotypes AA, Aa et aa
  • À partir de la fréquence du caractère récessif : q = √(fréquence des aa)
  • À partir des effectifs : q = (Aa + 2 × aa) ÷ (2 × effectif total)
  • Porteurs : 2pq, soit une personne sur 1 ÷ 2pq
  • Test du khi-deux : Σ (observé − attendu)² ÷ attendu, à 1 degré de liberté

Exemple chiffré : estimer les porteurs

Une maladie récessive touche une personne sur 2 500.

  1. q² = 1 ÷ 2 500 = 0,0004, donc q = 0,02.
  2. p = 1 − 0,02 = 0,98.
  3. Porteurs : 2 × 0,98 × 0,02 = 3,92 %, soit environ une personne sur 26.

Pour chaque personne atteinte, on compte donc environ 98 porteurs sains. C’est l’ordre de grandeur de la mucoviscidose, la plus fréquente des maladies génétiques graves de l’enfant en France : on estime qu’environ une personne sur 34 en est porteuse saine.

Caractère rare, porteurs fréquents

Fréquence du caractère q Porteurs (2pq)
1 sur 100 0,100 18,0 %, 1 sur 6
1 sur 1 000 0,032 6,1 %, 1 sur 16
1 sur 2 500 0,020 3,9 %, 1 sur 26
1 sur 10 000 0,010 2,0 %, 1 sur 51
1 sur 20 000 0,007 1,4 %, 1 sur 71

Exemple chiffré : tester l’équilibre

Sur un échantillon de 1 000 individus, on compte 360 AA, 470 Aa et 170 aa.

  1. q = (470 + 2 × 170) ÷ 2 000 = 0,405, p = 0,595.
  2. Effectifs attendus : 354 AA, 482 Aa, 164 aa.
  3. Le khi-deux vaut environ 0,62, pour une p-value de 0,43 : les effectifs sont compatibles avec l’équilibre.

Une p-value inférieure à 0,05 indiquerait qu’une des conditions n’est pas respectée.

Les conditions de l’équilibre

  • Une population de grande taille, pour que la dérive génétique soit faible
  • Des unions au hasard vis-à-vis du gène étudié
  • Ni mutation, ni migration
  • Pas de sélection naturelle sur les génotypes

Les populations réelles s’en écartent toujours un peu, mais pour de nombreux gènes les prédictions restent proches. Les écarts sont instructifs : un excès d’homozygotes peut révéler de la consanguinité ou une population structurée.

Limites

Le calcul suppose un caractère strictement récessif, présent chez toutes les personnes aa. En médecine, le dépistage des porteurs repose sur des tests génétiques directs, et les fréquences varient d’une population à l’autre.

Questions fréquentes

Que dit la loi de Hardy-Weinberg ?

p² + 2pq + q² = 1 : dans une population à l'équilibre, les fréquences des génotypes se déduisent des fréquences p et q des deux allèles, et restent stables d'une génération à l'autre.

Comment calculer la fréquence des porteurs sains ?

On prend q = √(fréquence des malades), puis 2pq. Si une personne sur 2 500 est atteinte, q = 0,02 et environ 3,9 % de la population, une personne sur 26, est porteuse.

Quelles sont les conditions de l'équilibre ?

Une grande population, des unions au hasard, et ni mutation, ni migration, ni sélection. Les populations réelles s'en approchent souvent pour de nombreux gènes.

Comment tester l'équilibre de Hardy-Weinberg ?

On compare les effectifs observés aux effectifs attendus p², 2pq et q² avec un test du khi-deux à 1 degré de liberté. Une p-value inférieure à 0,05 suggère un écart à l'équilibre.

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